Genotypning Verktyg

Genetiska forskare har gemensamma ansträngningar för att bestämma hela genetiska sekvensen , 9 miljarder baser , som finns i det mänskliga genomet . Genomet är DNA- innehåll hittades i varje mänsklig cell består av att upprepa kvävebaser märkta som " A ", " G ", " C " och " T " Genetik forskning fortsätter att leta efter variation i olika mänskliga genomet samt olika arter för evolutionära studier . Medicinska genetiska studier är intresserad av att hitta genetiska avvikelser eller genetisk variation som kan orsaka sjukdom . Genotypning är en metod för att bestämma genetisk variation utan att sekvensera hela genomet. Forskare isolera små regioner i ett genom att leta efter storleksskillnader , till följd av olika antal kvävebaser . Different bastal kan orsakas av en genetisk abnormalitet som resulterar i sjukdomar såsom diabetes, Alzheimers sjukdom och cancer. De verktyg som används för att utföra genotypning applikationer har utvecklats och utvecklas för att snabbt och exakt fastställa en enskild genotyp . Den Polymerase Chain Reaction

Utvecklingen av genteknik härstammar från utveckling av Polymerase Chain Reaction , eller PCR . Denna metod gör det möjligt för forskare att förstärka eller göra kopior av små regioner i en genomet inom timmar . Den region av intresse bestämmes genom tillsats av korta DNA- molekyler --- primers som matchar början och slutet av regionen av intresse. Har

PCR blivit ett ovärderligt verktyg för genetisk forskning. Amplifiering samma region från olika individer tillhandahåller en metod för jämförelse. Forensics identifiering använder för närvarande 15 olika regioner för jämförelse . En region kan matcha i olika människor . Dock bör inte två människor matcha alla 15 regioner .
Agarosgelelektrofores

PCR är metoden för att förstärka specificerade områden i DNA . Emellertid ger det inte en metod för att jämföra faktiska storleken av fragmenten . Produkter av PCR separeras efter storlek med användning av en gel-liknande material som kallas " agaros. " Mindre fragment migrerar snabbare över agaros som svar på en elektrisk ström i en process som kallas " agarosgelelektrofores. "

Efter PCR -fragmenten är lastade på agaros och migrerar längs gelén när en elektrisk ström appliceras. Etidiumbromid låter fragment att se när under ultraviolett ljus . Agarosgelelektrofores tillhandahåller en metod för snabb bestämning av framgångsrik PCR såväl som approximerar fragmentstorlek . Emellertid är nackdelen med agaros som ett verktyg för genotypning att fragment skall vara i huvudsak olika i storlek för korrekta resultat. Agaros ger inte ett bra medium för att jämföra fragment annorlunda med en enda bas .

Automatiserad Sequencers och Genetiska analysatorer
Fluorescerande märkta DNA-fragment som registrerats av en automatiserad sequencer .

Automatiserade sequencers och genetiska analysatorer har blivit det viktigaste verktyget som används i genotypning . Dessa tillåter fragment , olika av en enda kvävehaltig bas , som skall bestämmas snabbt och billigt. Som med agarosgelelektrofores , DNA-fragment först amplifieras med PCR. Dock är en primer märkt med en fluorescerande färg lägga till färg till fragment . Proverna separeras efter storlek genom att migrera genom en gelliknande polymer som svar på en elektrisk ström. Mindre fragment gå snabbare än större fragment . Eftersom fragmenten migrerar mot änden av polymeren , registrerar en digitalkamera färgen och skickar informationen till en dator för analys. Automatiserad sekvense utrustning används idag i rättsmedicinsk identifiering och faderskapstest .
Next Generation sequencers Bestäm också Genotyp

nästa generations sekvenseringsinstrumenthar snabbt vuxit fram under sedan 2006 . Detta teknik kombinerar PCR-amplifiering och sekvensering tillsammans för att fastställa miljoner baser på en gång . Processen börjar med PCR ; emellertid används olika primers bundna till pärlor blandas i ett reaktions tillåter tusentals regioner som skall amplifieras samtidigt.

Nästa generations sequencers separera då fragmenten efter storlek och tillåter en mångfald av DNA-regioner som skall analyseras. Metoden är ofördelaktig som genotypning verktyg när forskare är intresserade av att jämföra en enda region av genomet . Fördelen är att genomet isolerades från en enda cell ger tillräckligt material för PCR-amplifiering. Jämföra genotyper av normala och onormala celler som isolerats från en enda individ kan hjälpa till att identifiera cancerceller och potentiella behandlingar . Addera