Konvertera Sekvens till Fasta

Ett ​​gemensamt mål i medicinsk forskning innebär identifiering av fel , eller mutationer i DNA-sekvens som kan orsaka genetiska relaterad sjukdom . Teknik och datavetenskap har avancerad genetisk forskning till en nivå där tusentals sekvensdata kan analyseras samtidigt . En bestämmelse av nyare programvara är före konvertering av sekvensdata i FASTA -format . FASTA liknar enkel textformat . Det gör att flera delar av data som skall sammanställas i en enda fil och påskyndar analys . Men de flesta instrument genererar sekvens filer i textformat . Konvertera text till FASTA format är en enkel process med hjälp av textredigerare programvara . Detta är vad du behöver
Dator
text editor program
Visa fler Instruktioner
1

Öppna den utsedda DNA-sekvensen textfil med hjälp av textredigeringsprogram . Detta skulle vara Textredigeraren för MacIntosh och Anteckningsblock för Windows- kompatibla system . Original sekvens textfiler kan ha en alternativ förlängning såsom seq för data som genereras på en Applied Biosystems automatiserad genetisk analysator .
2

Börja den första raden genom att skriva > följt av en sekvens identifierare. Den är större än symbolen betecknar FASTA format för program som analyserar FASTA- data. Det finns inga särskilda regler för identifierare så länge det inte finns några utrymmen . Ett exempel på en acceptabel post för den första raden är > Cat_Isomerase_Exon3 . Addera 3

Tryck på " Return " för att skapa en radbrytning och börja den andra raden .
< Br > 4

Börja sekvensdata på linje två . FASTA riktlinjer format kräver DNA- textdata efter International Union of Pure and Applied Chemistry , IUPAC , koder . Varje rad är begränsad till 80 tecken som representerar 80 DNA-baser och kan vara stora eller små bokstäver . En godtagbar posten inklusive blandade baser är AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT .
5

Tryck på " Return " knappen för att börja nästa rad av sekvensdata . Varje rad ska bestå av 80 baser som representeras av IUPAC -kod .
6

Spara filen med hjälp av txt-fil förlängning eller lämplig FASTA filändelsen . Program som bearbetar FASTA formaterade data kräver ofta en FASTA viss anknytning såsom fsa , fna , FFN eller FRN . Addera