Stamcellerna som gör nya celler för att skydda tarmarna finns i botten av Lieberkühns krypter, som är små fingerliknande utsprång som kantar tunntarmen och tjocktarmen. Dessa stamceller kallas kryptbaskolumnära celler (CBC) och är ansvariga för att producera de olika celltyperna som utgör tarmslemhinnan, inklusive enterocyter (absorberande celler), bägareceller (slemutsöndrande celler), Paneth-celler (antimikrobiell peptid- utsöndrande celler) och enteroendokrina celler (hormonutsöndrande celler). CBC delar sig hela tiden för att producera nya celler som migrerar upp i kryptan och differentierar sig till olika typer av tarmceller. Denna process av cellförnyelse, känd som intestinal epitelcellomsättning, är väsentlig för att upprätthålla integriteten och funktionen hos tarmslemhinnan.