Reflexer är ofrivilliga, automatiska svar på stimuli. De styrs av ryggmärgen och hjärnstammen, utan inblandning av storhjärnan. Reflexer hjälper till att skydda kroppen från skada och upprätthålla homeostas. Till exempel hjälper knä-ryck-reflexen till att skydda knät från skador genom att få benet att sparka ut när knäet träffas. Pupillreflexen hjälper till att bibehålla rätt mängd ljus i ögat genom att få pupillerna att vidgas eller dra ihop sig som svar på förändringar i ljusnivån.