Prognosen för adenokarcinom av en okänd primär (CUP) är generellt sett dålig, med en 5-års överlevnad på cirka 5-10%. Detta beror på att CUP ofta diagnostiseras i ett framskridet stadium, när cancern redan har spridit sig till andra delar av kroppen. Prognosen för CUP kan variera beroende på den specifika typen av adenokarcinom och sjukdomsstadiet vid diagnos. Vissa typer av adenokarcinom är mer aggressiva än andra, och ju tidigare sjukdomen diagnostiseras och behandlas, desto bättre är prognosen.