Kroppens position för en koloskopi är vanligtvis liggande på vänster sida med knäna böjda och dragna upp mot bröstet. Denna position hjälper till att öppna upp tjocktarmen och göra det lättare för koloskopet att sätta in och flytta runt. Patienten kan också bli ombedd att vända sig på ryggen eller att ligga på höger sida under proceduren.