Streptokocker i halsen, även känd som streptokockfaryngit, orsakas vanligtvis av bakterien Streptococcus pyogenes, allmänt känd som grupp A Streptococcus (GAS). Ibland kan andra stammar av Streptococcus, såsom Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (grupp C streptokocker), kan också orsaka halsfluss.