Den primära molekylen som avlägsnas av lungorna är koldioxid (CO2). Koldioxid är en avfallsprodukt från cellandningen och transporteras från vävnaderna till lungorna via blodomloppet. Väl i lungorna andas CO2 ut i atmosfären under andningsprocessen. Lungorna spelar en avgörande roll för att reglera nivåerna av koldioxid i blodomloppet, upprätthålla kroppens syra-basbalans och säkerställa att olika fysiologiska system fungerar korrekt.