Storleken på den mänskliga hjärnan varierar avsevärt mellan individer, utan någon tydlig skillnad baserad enbart på förekomsten av autism. Hjärnstorlekar och strukturer skiljer sig peuvent mellan personer med autism, men dessa variationer är inte konsekventa och kan också hittas i den allmänna befolkningen. Hjärnans utveckling och storlek påverkas av olika faktorer som genetik, miljö och individuella upplevelser, snarare än att direkt bestäms av autism.