Hjärtfrekvensen styrs inte direkt av hjärnan. Istället styrs den av sinoatrial node (SA node), som är en liten grupp celler som finns i hjärtats högra förmak. SA-noden är ansvarig för att generera de elektriska impulser som får hjärtat att dra ihop sig. Hjärnan kan dock indirekt påverka hjärtfrekvensen genom det autonoma nervsystemet, som är ansvarigt för att kontrollera många av kroppens ofrivilliga funktioner, såsom andning och matsmältning. Det autonoma nervsystemet har två grenar:det sympatiska nervsystemet och det parasympatiska nervsystemet. Det sympatiska nervsystemet påskyndar hjärtfrekvensen, medan det parasympatiska nervsystemet saktar ner den. När kroppen är i vila är det parasympatiska nervsystemet dominant och hjärtfrekvensen långsam. När kroppen är stressad är det sympatiska nervsystemet dominerande och pulsen ökar.
