Ja, BrainPOP kräver en prenumeration för att få tillgång till sina utbildningsresurser. Kostnaden för ett abonnemang varierar beroende på typen av åtkomst och antalet användare. Prenumerationer kan köpas på månads- eller årsbasis. För skolor och distrikt erbjuder BrainPOP rabatterade priser baserat på antalet elever och lärare. Förutom ett grundläggande abonnemang erbjuder BrainPOP även tilläggsfunktioner som onlinebedömningar, lektionsplaner och lärarutbildning.