Det finns inget botemedel mot munsår, men det finns flera sätt att behandla dem för att minska smärta och obehag. Några exempel är:aktuella antivirala läkemedel, orala antivirala medel som acyklovir, famciklovir eller valacyklovir., naturläkemedel som att applicera is, kokosolja eller tea tree-olja och smärtstillande medel som ibuprofen eller paracetamol.