HIV förstör inte hjärnceller och orsakar förvirring och minnesförlust. Istället kan hiv infektera de celler som stödjer hjärnceller och därigenom indirekt påverka hjärnan. I vissa fall kan HIV leda till ett tillstånd som kallas HIV-associerade neurokognitiva störningar (HAND), som kan orsaka en rad kognitiva problem, inklusive förvirring, minnesförlust, svårigheter att tänka och koncentrera sig och förändringar i personlighet och beteende. HAND orsakas dock inte av att HIV direkt förstör hjärnceller.