En långsiktig effekt förknippad med lägre östrogennivåer är den ökade risken för att utveckla benskörhet, ett tillstånd som försvagar benen och gör dem mer benägna att gå sönder. Östrogen är känt för att hjälpa till att upprätthålla bentäthet och styrka. Eftersom östrogennivåerna sjunker under klimakteriet kan kvinnor uppleva en förlust av benmassa, vilket leder till en ökad risk för frakturer och benförlust.