Antikroppar binder till antigener som finns på ytan av patogener och förhindrar därigenom deras inträde i värdceller. I de fall där antikroppar ensamma inte effektivt kan neutralisera patogener, aktiveras komplementsystemet som är nära förknippat med antikroppar. Aktivering av komplementsystemet resulterar i lys (brytning) av patogener. Antikroppar tillhandahåller således både direkta och indirekta försvarsmekanismer.