Alla sjukdomar orsakas inte av mikroorganismer. Vissa sjukdomar, såsom genetiska störningar, autoimmuna sjukdomar och skador, orsakas inte av mikroorganismer. Även om mikroorganismer är orsaken till många sjukdomar som påverkar människors hälsa. Bakterier, virus, svampar och parasiter kan alla orsaka sjukdomar hos människor.