Det exakta antalet patogener är inte känt eftersom nya ständigt upptäcks. Det finns miljontals olika typer av mikroorganismer som förekommer naturligt, inklusive bakterier, virus, svampar och parasiter, och många av dessa orsakar sjukdomar hos människor, djur och växter. Antalet erkända patogena arter är stort och inkluderar över 1 400 mänskliga patogener inklusive 217 virus, 527 typer av bakterier, 302 arter av svampar och 397 typer av parasiter.