Det endokrina systemet samarbetar nära med det reproduktiva systemet för att reglera sexuell utveckling, menstruationscykler, graviditet och klimakteriet. Hypothalamus och hypofysen, som frigör hormoner, spelar en avgörande roll för att kontrollera frisättningen av andra reproduktiva hormoner inklusive östrogen, progesteron, testosteron och folliklar.