Tunntarmen är ansvarig för att bryta ner stora, komplexa molekyler till mindre, absorberbara molekyler. Detta görs genom mekanisk rötning, kemisk rötning och absorption. Mekanisk matsmältning innebär fysiskt att bryta ner maten i mindre bitar genom tuggning, muskelsammandragningar och gallans verkan. Kemisk nedbrytning innebär användning av enzymer för att kemiskt bryta ner kolhydrater, proteiner och fetter till enklare molekyler. Absorption är den process genom vilken dessa enklare molekyler tas upp i blodomloppet genom tunntarmens väggar.