Mat som inte smälts och absorberas passerar genom tjocktarmen, även känd som kolon. I tjocktarmen absorberas vatten och elektrolyter från det återstående matmaterialet och bakterier fermenterar de osmälta kolhydraterna och producerar gaser som väte, koldioxid och metan. Det återstående avfallsmaterialet, tillsammans med dessa gaser, bildar avföring, som lagras i ändtarmen tills det elimineras genom avföring.