Enzymet som produceras av magen kallas pepsin. Pepsin är ett proteasenzym som bryter ner proteiner till mindre peptider. Det utsöndras av huvudcellerna i magkörtlarna i magen. Pepsin är aktivt i den sura miljön i magen, med ett optimalt pH på cirka 1,5 till 2,0. Det fungerar tillsammans med andra enzymer som saltsyra och slem för att smälta maten och förbereda den för absorption i tunntarmen.