Processen som frigör matsmältningsenzymer kallas sekretion. Sekretion är den process genom vilken celler frigör ämnen, såsom enzymer, hormoner eller andra molekyler, till den extracellulära miljön. I samband med matsmältning utsöndras matsmältningsenzymer av celler i matsmältningskanalen, såsom spottkörtlarna, magen, bukspottkörteln och tunntarmen. Dessa enzymer hjälper till att bryta ner mat till mindre molekyler som kan tas upp av kroppen.