De flesta makromolekyler smälts i tunntarmen. Tunntarmen är ett långt, lindat rör som förbinder magsäcken med tjocktarmen. Den är fodrad med villi, som är små fingerliknande utsprång som ökar tarmens yta och hjälper till att absorbera näringsämnen. Tunntarmen producerar också enzymer som bryter ner makromolekyler till mindre molekyler som kan tas upp i blodomloppet.