Tjocktarmen smälter inte maten. Dess huvudsakliga roll är att absorbera vatten från matrester och att lagra avföringen tills den kan elimineras. Däremot innehåller tjocktarmen vissa bakterier som kan jäsa en del av matrester, frigöra gaser och producera några kortkedjiga fettsyror som kan användas som energikälla av cellerna i tjocktarmen. Tunntarmen är ansvarig för huvuddelen av matsmältningen och näringsupptaget.