Laktosintolerans varierar inom den japanska befolkningen. Omkring 20-30% av japanska individer kan ha en viss grad av laktosintolerans, även om inte alla kan uppleva symtom. Prevalensen är generellt sett lägre än i vissa västerländska befolkningar, där den kan vara så hög som 75 %. Genetiska variationer, skillnader i lokala livsmedel och anpassning till ett lägre intag av mejeriprodukter genom åren kan alla spela en roll i denna variation.