Det muskulära röret i matsmältningssystemet kallas matsmältningskanalen. Det börjar vid munnen och slutar vid anus. Det är genom matsmältningskanalen som maten intas, smälts, absorberas och avfallsprodukterna från matsmältningen elimineras. Matsmältningskanalen består av munnen, svalget, matstrupen, magen, tunntarmen, tjocktarmen, ändtarmen och anus. Munnen är där maten intas och tuggas, svalget är passagen från munnen till matstrupen, matstrupen är röret som transporterar mat från svalget till magsäcken, magsäcken är där maten bryts ned av syror och enzymer, tunntarmen är där det mesta av matsmältningen och absorptionen av näringsämnen sker, tjocktarmen är där vatten och elektrolyter absorberas och avfallsprodukterna från matsmältningen bildas, ändtarmen är den sista delen av tjocktarmen och anus är där avfallsprodukterna drivs ut.