Utsöndring är inte en funktion av matsmältningssystemet. Matsmältningssystemets primära funktioner inkluderar den mekaniska och kemiska nedbrytningen av mat till näringsämnen som kroppen kan absorbera, samt absorption och utnyttjande av dessa näringsämnen. Utsöndringsprocessen, som innebär att avfallsprodukter avlägsnas från kroppen, utförs i första hand av urinvägarna och andningsorganen.