En fagolysosom innehåller material som har fagocyterats och som håller på att smältas. En fagolysosom är en membranbunden organell som bildas genom sammansmältning av en fagosom och en lysosom. Fagosomen är en liten vesikel som innehåller material som har fagocyterats eller uppslukats av en cell. Lysosomen är en liten vesikel som innehåller matsmältningsenzymer. När en fagosom och en lysosom smälter samman frigörs matsmältningsenzymerna i lysosomen till fagosomen och materialet inuti fagosomen bryts ner till mindre molekyler.