Det finns ingen generell kontraindikation för användning av melatonin hos personer med autoimmuna sjukdomar. Melatonin, ett naturligt förekommande hormon som främst är involverat i att reglera sömn-vakna cykler, har i allmänhet ansetts vara säkert och vältolererat. Medan forskning om melatonins potentiella interaktioner med specifika autoimmuna tillstånd pågår, finns det ingen etablerad kontraindikation som förbjuder dess användning hos individer med autoimmuna sjukdomar. Om en individ har vissa medicinska tillstånd eller pågående behandlingar är det alltid lämpligt att konsultera en sjukvårdspersonal innan du tar melatonin, eller något tillskott eller medicin, för att individualisera sin vård och ta itu med eventuella problem.