Sekventiell Chip Protokoll

Sekventiell kromatin immunoprecipitation , som kallas SeqChIP , är ett biologiskt test syftar till att fastställa på vilket sätt två proteiner interagerar inom en region i en deoxiribonukleinsyra ( DNA ) -strängen . Forskare engagera en specifik uppsättning av beställda uppdrag att avslöja tre möjliga relationer mellan proteiner under bedömning . Som med de flesta vetenskapstester, det varelser med rengöring och slutar med slutsats . Enligt Harvard forskare , kan tekniska framsteg inom SeqChIP analys hjälper forskarna att mer allmänt studera biologiska fenomen . Förbered

SeqChIP experiment innehåller noggranna förberedelser för att desinficera och rengöra magnetiska kulor för experiment . Forskare måste tvätta pärlor flera gånger och rengör dem i " block" -lösning . Pärlorna suspenderades sedan för torkning och åter tvättas. Generellt forskare lämnar en dag före den slutliga tvätt innan vi går vidare till länkningsstadiet. Med tanke på olika DNA-strängar för bedömning , detta stadium av förberedelse varierar också i komplexitet . Dock fortfarande en vetenskaplig sanning : det renare testet , renare resultatet

förnäta

Forskare väljer DNA- proteinkomplex , eller områden i strängen , för förbättring . med en antikropp . I själva verket , biologer ställs mot varandra proteiner för att observera deras interaktion . När observeras , behöver tvärbinda bekräftas i omvänd ordning . Har proteinerna fortfarande relatera när sekvensen är omvänd ? SeqChIP forskare tror att den samtidiga förekomsten av både proteiner när bedömas i motsatt riktning ger övertygande bevis för fullständig sam - beläggning , och medger entydig differentiering av partiell beläggning och ingen co - beläggning . Addera
Rena

Polymerase Chain Reaction , eller " PCR ", är en DNA - förstärkningsprocesssom kontrollerar kvalitet eller renhet , av DNA . PCR utförs i tre etapper. Först PCR smälter trådarna isär genom att höja temperaturen. Då forskarna föra de två mall trådarna tillbaka tillsammans med PCR-primers . Slutligen , biologer inkubera DNA så att polymeras primers orsakar celler under undersökning för att kluster . Däri forskare flyttar till granskningen av klustren .
Bedöma

Analysis granskar DNA-strängarna för närvaro eller frånvaro av " beläggning ", ett interaktivt förhållande mellan proteiner. Två proteiner som alltid associerar med samma DNA-fragment som har fullständig sam- beläggning, ingen samtidig beläggning uppstår när proteinerna endast kan associera i inbördes exklusiva delpopulationer av DNA-strängen ; partiell samtidig beläggning innebär att vissa DNA-molekyler som har både proteiner , medan andra har det ena eller det andra . Om SeqChIP testning är en procedur i strängen av biologin , det ger forskare med möjligheten att tillämpa singulära resultat till en hel genomisk struktur . Addera