Namnet "Medusa" tros komma från det grekiska ordet "medein", som betyder "att härska eller skydda." Detta beror troligen på Medusas roll som beskyddare och förmyndare i den grekiska mytologin. Dessutom kan namnet "Medusa" också härledas från det grekiska ordet "medomai", som betyder "att tänka eller tänka." Detta kan syfta på Medusas kloka och listiga natur, såväl som hennes förmåga att förvandla människor till sten med en enda blick.