Desinfektion är en process för att eliminera nästan alla patogena mikroorganismer, förutom bakteriesporer, på livlösa föremål och ytor. Desinfektion dödar inte nödvändigtvis alla mikroorganismer, särskilt resistenta bakteriesporer; den är mindre grundlig än sterilisering, som syftar till att förstöra alla typer av liv. Många desinfektionsmetoder är effektiva mot de flesta kända patogener, men misslyckas mot vissa mikroorganismer som prioner.
Exempel på desinfektion inkluderar kokande vatten, alkohol, UV-ljus och kemiska medel som blekmedel. Till skillnad från den fullständiga elimineringen av mikroorganismer som uppnås med steriliseringsprocesser, är desinfektion i allmänhet ineffektiv mot bakteriesporer.