Tonsilstenar är sammansatta av bakterier, matrester och döda celler som ackumuleras i tonsillernas sprickor. Bakterierna bryter ner proteinet i stenarna och frigör flyktiga svavelföreningar som ger en illaluktande lukt. Denna lukt liknar den från ruttna ägg eller sopor och kan vara ganska obehaglig. Dessutom kan tonsillstenar hysa en rad andra bakteriearter, av vilka några producerar metabola avfallsprodukter som ytterligare bidrar till den dåliga lukten. Dålig munhygien, rökning och vissa medicinska tillstånd kan öka risken för att utveckla tonsillstenar och förvärra den associerade lukten.