Bariatrisk kirurgi anses vanligtvis inte vara ett behandlingsalternativ för patienter med Crohns sjukdom. Huvudsyftet med att hantera Crohns sjukdom är att inducera och bibehålla remission, förebygga eller behandla komplikationer, minimera kirurgi och förbättra livskvaliteten. Bariatrisk kirurgi är i första hand indicerad för behandling av svår fetma, snarare än Crohns sjukdom.